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La ville a une population de 120,000 habitants et est la cinquième ville de Grèce. Héraklion, dans les temps anciens, n était que le port de Knossos et ce n est qu au 9ème siècle après JC qu elle apparait comme une ville fondée par les Sarrasins.
Héraklion devint le centre du marché aux esclaves en Méditérranée, et fut ensuite prise par les Vénitiens qui construisèrent d immenses murs de fortification, l appelèrent Kandax qui fut changé ensuite pour Candia. Pendant les 4 siècles d occupation vénitienne en Crète, de nombreux batiments seront construits, excellents exemples d architecture vénitienne de l époque, et nombre d entre eux existent encore.
La basilique de Saint Marc et la Loggia en sont deux specimens , tandis que la fontaine Morozini avec ses 4 lions a meme donné son nom au point central de rencontre de la ville.
Aujourd hui Héraklion est très priviligié d avoir dans ses faubourgs le fameux Knossos, la ville la plus remarquble de l ère minoenne. Relié directement à Knossos, se trouve le Musée Archéologique d Héraklion logeant les plus importantes découvertes non seulement de Knossos mais aussi d autres palais minoens comme Phaestos dans le sud, Malia à l Est et Zakros à l extreme Est de Crète.